Nationellt referenslaboratorium för herpesvirus (HSV-1, HSV-2, VZV, CMV, EBV, HHV-6, HHV-7, HHV-8, HVS)
Här finns information om analyser, svarstider, avgifter och uppdragsbeskrivning.
Ansvarigt laboratorium
Sahlgrenska Universitetssjukhuset
- Avdelning: Klinisk mikrobiologi
- Verksamhetschef: Peter Brodin
Omfattning
HSV-1, HSV-2, VZV, CMV, EBV, HHV-6, HHV-7, HHV-8 och HVS.
Kontaktuppgifter och tillgänglighet
Virologiska laboratoriet har 24-timmars jour och nås via växeln vid Sahlgrenska Universitetssjukhuset, telefon 031-342 10 00. Vid behov tar jourhavande virolog kontakt med ansvariga medarbetare för herpesvirusdiagnostiken på laboratoriet.
Ledare av NRL: Jan-Åke Liljeqvist docent, universitetssjukhusöverläkare.
Referensdiagnostik
Svarstider och slutsvar. Alla analyser, som specificeras enligt nedan, förutom genotypisk antiviralresistens av CMV och HSV (tar 1-2 veckor), kan besvaras inom 24 timmar måndag – lördag från det att provet anlänt till laboratoriet. Svar kommer att levereras som pappers- och vid behov som telefonsvar.
Analys | Metod | Avgift |
---|---|---|
CMV; IgG, kvantitativ | CMIA | 386 kr |
CMV; IgM, kvalitativ | CMIA | 470 kr |
Analys | Metod | Avgift |
---|---|---|
CMV; DNA,kvalitativ | realtidsPCR | 589 kr |
CMV; DNA,kvantitativ | realtidsPCR | 1 268 kr |
Analys | Metod | Avgift |
---|---|---|
CMV; DNA-polymeras (UL54) | PCR | 927 kr |
CMV; DNA-polymeras (UL54) | sekvensering | 1 087 kr |
CMV; DNA Proteinkinas (UL97) | PCR | 927 kr |
CMV; DNA Proteinkinas (UL97) | sekvensering | 1 087 kr |
Analys | Metod | Avgift |
---|---|---|
EBV; kärnantigen, IgG | CMIA | 386 kr |
EBV; kapsidantigen, IgG | CMIA | 386 kr |
EBV; kapsidantigen, IgM | CMIA | 386 kr |
Analys | Metod | Avgift |
---|---|---|
EBV; DNA, kvalitativ | realtidsPCR | 641 kr |
EBV; DNA kvantitativ | realtidsPCR | 601 kr |
Analys | Metod | Avgift |
---|---|---|
HSV; IgG, semikvantitativ (titer) | ELISA | 301 kr |
HSV; IgM, kvalitativ | ELISA | 470 kr |
HSV typ 1; IgG, kvalitativ | ELISA | 301 kr |
HSV typ 2; IgG, semikvantitativ (titer) | ELISA | 301 kr |
HSV typ 2; IgG, konfirmation, kval. | ELISA | 413 kr |
Analys | Metod | Avgift |
---|---|---|
HSV; DNA, kvalitativ | realtidsPCR | 769 kr |
HSV typ 1; DNA kvantitativ | realtidsPCR | 732 kr |
HSV typ 2; DNA kvantitativ | realtidsPCR | 732 kr |
Analys | Metod | Avgift |
---|---|---|
HSV; DNA-polymeras (UL30) | PCR | 1 838 kr |
HSV; DNA-polymeras (UL30) | Sekvensering | 2 821 kr |
HSV; DNA tymidinkinas (UL23) | PCR | 1 838 kr |
HSV; DNA tymidinkinas (UL23) | sekvensering | 2 821 kr |
Analys | Avgift |
---|---|
HSV; uppodling, isolering samt frysarkivering av virus, ingår vid resistenbestämning. | 563 kr |
Tabell 10 med referensdiagnostik för Humant herpes virus 6 serologi.
Analys | Metod | Avgift |
---|---|---|
HHV-6; IgG | ELISA | 470 kr |
Tabell 11 med referensdiagnostik för Humant herpes virus 6 PCR.
Analys | Metod | Avgift |
---|---|---|
HHV-6; DNA, kvalitativ | realtidsPCR | 601 kr |
HHV-6; DNA, kvantitativ | realtidsPCR | 732 kr |
Tabell 12 med referensdiagnostik för Humant herpes virus 7 PCR.
Analys | Metod | Avgift |
---|---|---|
HHV-7; DNA, kvantitativ | realtidsPCR | 928 kr |
Tabell 13 med referensdiagnostik för Humant herpes virus 8 PCR.
Analys | Metod | Avgift |
---|---|---|
HHV-8; DNA, kvantitativ | realtidsPCR | 928 kr |
Tabell 14 med referensdiagnostik för Varicella zoster virus serologi.
Analys | Metod | Avgift |
---|---|---|
VZV; IgG, semikvantitativ (titer) | ELISA | 301 kr |
VZV; IgM, kvalitativ | ELISA | 470 kr |
VZV; IgG, konf, kvantitativ | CLIA | 470 kr |
Tabell 15 med referensdiagnostik för Varicella zoster virus PCR.
Analys | Metod | Avgift |
---|---|---|
VZV; DNA, kvalitativ | realtidsPCR | 601 kr |
VZV; DNA, kvantitativ | realtidsPCR | 732 kr |
Tillägg: För Akutprov: 503 kr.
Avgifter enligt avtal 2019-01-01 har uppdaterats 2022-04-29. Dessa kan årligen höjas motsvarande landstingsindex/konsumentprisindex (LPI/KPI), eller vid behov högre efter förankring i SLIM styrgrupp.
Kompletterande serologisk diagnostik; Om behov uppkommer för serologisk diagnostik av IgM-antikroppar mot HHV-6 och/eller IgG och IgM-antikroppar mot HHV-7 har vi kontakt med Public Health England, Virus reference department (VRD)
Guidance: Specialist and reference microbiology: laboratory tests and services (gov.uk)
Diagnostik av herpes simian B virus
- Laboratoriet har kontakt med Robin Gopal, ansvarig vid ”High Containment Microbiology, National Infections Service Public Health England”: +44(0)208 327 6437 eller +44(0)208 327 6222.
- Serologisk diagnostik är osäker och utförs ej. Om misstanke om herpes B virus infektion uppkommer, får kontakt tas med viruslaboratoriet i Göteborg för vidare diskussion om PCR alt. virusisolering i samråd med Robin Gopal PHE. Hänvisar också till dokument från PHE angående ”Monkey bite guidance” som är tillgänglig vid virologiska laboratoriet i Göteborg och vid FOHM.
- PCR. Det material som den exponerade kommit i kontakt med – till exempel saliv, urin, blod eller nervvävnad – kan analyseras med PCR. Hos en infekterad individ kan virus ibland påvisas i hudlesioner, ögonsekret eller saliv.
- Virusisolering kräver säkerhetsklass 3 på laboratoriet och utförs vid PHE efter kontakt.
Referensmaterial
På laboratoriet sparas alla prover med klinisk herpesvirus frågeställning 10 år i en biobank. Det finns därför omfattande referensmaterial för HSV-1, HSV-2, VZV, CMV, EBV och HHV-6 vilka kan användas vid utvärdering av ny metodik eller som positiv kontroll, samt tillhandahålla referensmaterial för serologiska kvalitetspaneler.
Expertstöd
Expertis inom fältet finns på laboratoriet för stöd vid särskilda frågeställningar via telefon eller e-post.
För akut rådgivning finns möjlighet att nå jourläkare dygnet runt.
Utveckling och samverkan
Laboratoriet har omfattande erfarenhet av utveckling och validering av metoder för påvisande av herpesvirus med serologi och med realtids-PCR. Utvärderar nya diagnostiska metoder inom fältet. Det finns en bred erfarenhet och kunskap som kan stödja andra laboratoriers metodutveckling och validering av tester och metoder.
Omvärldsbevakning och beredskap
Laboratoriet har ett nära samarbete med Smittskyddsenheten i regionen. Vi följer noga forskningsfältet genom att ta del av publikationer och genom att medverka i nationella och internationella möten och konferenser.
Den omfattande erfarenheten av egenutvecklade diagnostiska metoder gör att vi snabbt kan anpassa eller vid behov utveckla nya metoder.