Mikrobiell övervakning av ehec 2022 – halvårsrapport
LyssnaDetta är en rapport som publiceras 2 gånger per år med fokus på den epidemiologiska typning av ehec som utförs på Folkhälsomyndigheten. Justering av data kan förekomma på grund av viss eftersläpning av anmälningar i SmiNet.
Sammanfattning
Generellt har antalet isolat som inkommit för epidemiologisk typning vid Folkhälsomyndigheten ökat i och med den rådande situationen med covid-19 pandemin som blivit mer normaliserat. Totalt inkom 132 isolat för typning under första halvåret 2022, förra året hade det inkommit 95 isolat under första halvåret. Ehec påvisades i 125 av de 132 isolaten.
Under perioden 1 januari till 30 juni 2022 anmäldes 282 fall av ehec-infektion. 199 fall (70 procent) av de anmälda fallen var inhemskt smittade, vilket är en lägre andel i jämförelse med 2021. Detta speglar också mest troligt covid-19 pandemin och dess påverkan på resvanor och att vi börjar resa igen. 16 fall (6 procent) av de anmälda fallen hade okänt smittland och 67 fall (24 procent) var rapporterade som utlandssmittade.
Av de 282 anmälda fallen med ehec-infektion, inkom 132 isolat till Folkhälsomyndigheten för epidemiologisk typning. Isoleringsfrekvensen för halvåret 2022 låg på 47 procent, vilket är något lägre jämfört med tidigare år 2021 och 2020 som var över 50 procent.
I två av de inkomna proven kunde ehec detekteras men inte isoleras. Ett isolat var inte ehec. Övriga isolat fördelade sig i 55 olika serotyper (figur 1, tabell 1). Vanligast förekommande var O157:H7 (16 procent) detta inkluderar klon 8 också, följt av O26:H11 (13 procent), följt av serotyperna O27:H30 och O103:H2 på (6 procent) vardera. O26:H11 är den mest frekventa så kallade non-O157:H7 serotypen i Europa.
Den vanligast förekommande shigatoxinsubtypen var stx1a (25 procent) följt av stx2b (19 procent) och stx2a (13 procent) (figur 2). O26:H11 kan bära på olika varianter av shigatoxinsubtyper, antingen är de stx1a, stx1a + stx2a eller stx2a, vilket högst troligt indikerar variation i hur pass patogen denna serotyp kan vara. Vanligast är att de bär på gener för stx1a, så även under denna period, (tabell 1).
Figur 1. Fördelning av serotyper och smittland för inkomna isolat under perioden 1 januari till 30 juni 2022 (n=132). Serotyperna som endast har under fyra fall rapporteras som övriga serotyper.
Serotyp | Toxin | eae | Antal isolat per toxintyp | Antal isolat per serotyp |
---|---|---|---|---|
:H49 | stx1a | eae- | 1 | 1 |
O103:H2 | stx1a | eae+ | 7 | 7 |
O108:H25 | stx2a | eae+ | 1 | 1 |
O111:H8 | stx2a | eae+ | 2 | 2 |
O113:H21 | stx2a | eae- | 1 | 1 |
O113:H4 | stx1c, stx2b | eae- | 4 | 5 |
O113:H4 | stx2b | eae- | 1 | |
O116:H48 | stx2a | eae- | 1 | 2 |
O116:H48 | stx2a, stx2d | eae- | 1 | |
O117:H7 | stx1a | eae- | 1 | 1 |
O12:H4 | stx2f | eae+ | 1 | 1 |
O121:H19 | stx2a | eae+ | 1 | 1 |
O128:H2 | stx2b | eae- | 3 | 4 |
O128:H2 | stx1c | eae- | 1 | |
O145:H28 | stx2a | eae+ | 4 | 4 |
O145:H34 | stx2f | eae+ | 1 | 1 |
O146:H21 | stx1c, stx2b | eae- | 3 | 6 |
O146:H21 | stx2b | eae- | 2 | |
O146:H21 | stx1c, stx2a | eae- | 1 | |
O146:H28 | stx2b | eae- | 3 | 3 |
O150:H7 | stx1a | eae- | 1 | 1 |
O150:H8 | stx1c | eae- | 1 | 1 |
O154:H31 | stx1d | eae- | 1 | 1 |
O157:H7 | stx2c | eae+ | 5 | 11 |
O157:H7 | stx1a, stx2a | eae+ | 3 | |
O157:H7 | stx1a, stx2c | eae+ | 1 | |
O157:H7 | stx2a | eae+ | 1 | |
O157:H7 | stx2a, stx2c | eae+ | 1 | |
O157:H7, clade 8 | stx2a, stx2c | eae+ | 6 | 8 |
O157:H7, clade 8 | stx2a | eae+ | 2 | |
O166:H28 | stx1c | eae- | 1 | 1 |
O168:H8 | stx2c, stx2d | eae- | 1 | 1 |
O171:H25 | stx2d | eae- | 1 | 1 |
O174:H21 | stx2d | eae- | 1 | 1 |
O174:H8 | stx1c, stx2b | eae- | 1 | 1 |
O177:H25 | stx2c | eae+ | 2 | 2 |
O185:H7 | stx2c | eae- | 1 | 1 |
O187:H28 | stx2g | eae- | 1 | 1 |
O22:H1 | stx2b | eae- | 1 | 1 |
O26:H11 | stx1a | eae+ | 14 | 15 |
O26:H11 | stx2a | eae+ | 1 | |
O27:H30 | stx2b | eae- | 7 | 7 |
O43:H2 | stx2b | eae- | 2 | 2 |
O63:H6 | stx2f | eae+ | 2 | 2 |
O66:H25 | stx2b | eae- | 1 | 1 |
O66:H45 | stx2b | eae- | 1 | 1 |
O78:H4 | stx1c | eae- | 4 | 4 |
O8:H19 | stx2a | eae- | 1 | 1 |
O8:H19 | stx2e | eae- | 1 | 1 |
O8:H9 | stx2e | eae- | 1 | 1 |
O81:H21 | stx1c | eae- | 1 | 1 |
O81:H6 | stx2f | eae+ | 1 | 1 |
O91:H14 | stx1a | eae- | 3 | 5 |
O91:H14 | stx1a, stx2b | eae- | 1 | |
O91:H14 | stx2b | eae- | 1 | |
O98:H21 | stx1a | eae+ | 1 | 1 |
ONT:H2 | stx1a | eae+ | 3 | 4 |
ONT:H2 | stx2a | eae+ | 1 | |
ONT:H4 | stx1c, stx2b | eae- | 1 | 1 |
ONT:H6 | stx2b | eae- | 1 | 1 |
ONT:H7 | stx1c | eae- | 1 | 1 |
Figur 2. Fördelning av shigatoxinsubtyper och eae för inkomna isolat under perioden 1 januari till 30 juni 2022 (n= 132).
HUS
Hemolytiskt uremiskt syndrom (HUS) är en allvarlig komplikation vid ehec-infektion. Förekomst av stx2 är associerad med svårare sjukdomsbild än stx1 och framför allt stx-subtypen stx2a (med eller utan stx2c) är starkt associerad med utveckling av HUS.
Under halvåret 2022 har fyra fall av HUS anmälts, två av fallen var under fem år. Endast ett av fallen (25 procent) har haft den virulenta shigatoxinsubtypen stx2a ensam, två av fallen hade shigatoxinsubtypen stx2b och ett av fallen hade endast stx1a, (tabell 2). Sedan november 2016 bistår Folkhälsomyndigheten vid isolering av HUS-fall.
Kvartal | Fall | Serotyp | Toxinsubtyp | eae | Smittland |
---|---|---|---|---|---|
1 | Fall 1 | O113:H4 | stx1c, stx2b | eae- | Inhemsk |
1 | Fall 2 | :H2 | stx1a | eae+ | Inhemsk |
1 | Fall 3 | O146:H21 | stx2b | eae- | Inhemsk |
2 | Fall 4 | O111:H8 | stx2a | eae+ | Inhemsk |
Utredning vid misstänkt gårdskoppling
Ingen gårdsutredning har skett under första halvåret 2022.
ESBL
Två isolat identifierades som ESBL-producerande under första halvåret 2022, båda fallen var utlandsmittade. Isolaten bar på CTX-M-15.
Hybridisolat
Två fall bär på isolat som är hybrider av ehec och etec (enterotoxinproducerande E. coli). Både isolaten var positivt för stx2g och sta. Genen sta är en virulensmarkör för etec som kodar för värmestabilt toxin (ST). Ett av fallen var rapporterade som inhemskt smittade och smittorten för det andra fallet var utland, (tabell 3).
Fall | Serotyp | Toxinsubtyp | eae | sta | Smittland |
---|---|---|---|---|---|
1 | O187:H28 | stx2g | Negativ | Positiv | Utland |
2 | O187:H28 | stx2g | Negativ | Positiv | Inhemsk |