Enterococcus faecium och Enterococcus faecalis (vancomycinresistenta enterokocker ,VRE) (Sekvensering)
LyssnaHelgenomsekvensering för påvisning av vankomycinresistens, artverifiering och epidemiologisk typning.
- Indikation
-
Verifiering av Enterococcus faecalis och Enterococcus faecium som VRE samt smittspårning och utbrottsutredningar.
- Provmaterial
-
Bakterieisolat i transportmedium.
- Provtagningsanvisningar
-
Ange på remissen från vilket material provet isolerats, provtagningsdatum och övriga uppgifter av betydelse. Om telefonsvar önskas måste detta anges på remissen tillsammans med telefonnummer och kontaktperson.
- Transport
- Svarstid
- Inom 5 till 10 arbetsdagar
- Ackrediterad
- Ja
- Anmälningspliktig enligt SML
-
Ja
Anmälan till SmiNet görs för isolat som verifieras som VRE samt en komplettering till SmiNet-anmälan med eventuell typbeteckning görs för VRE.
- Avgiftsbelagd
- Se prislista (PDF, 463 kB)(Öppnas i nytt fönster)
- Övrig information
-
Avgiftsfri inom ramen för det mikrobiologiska nationella övervakningsprogrammet.
Helgenomsekvensering för genetisk påvisning av:
- ddl E. faecium, ddl E. faecalis
- vanA, vanB (ackrediterad analys)
- vanD
- övriga van-gener
- Gener/mutationer kopplade till linezolidresistens
Epidemiologisk typning:
- SNP-analys
Isolat som bedöms som relaterade får en nationell typbeteckning enligt den nomenklatur som Folkhälsomyndigheten definierat för VRE.